病原微生物引起的感染性疾病是临床最常见的疾病之一,随着人群结构变化以及各类抗菌药物的广泛应用,病原体呈现多样化和复杂化的趋势,增加了临床诊断及治疗的难度。因此全面、快速、准确的病原学检测,已经成为临床刚需。荻硕贝肯应用超多重荧光pcr技术开发的靶向病原产品(109种病原体筛查),一次可覆盖百余种常见病原体,检测敏感度高、结果准确,可满足临床快速诊断、缩短患者病程的需求。












多重pcr技术在感染检测中的应用

在病原微生物检测方面,多重pcr技术(mpcr)是一个有力工具,其检测范围涵盖病毒、细菌、真菌、寄生虫等。主要应用在阳性血培养的快速检测、呼吸道病原体的多重检测、中枢神经系统感染相关病原体的多重检测。

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血流感染


血培养目前是临床诊断细菌性血流感染的金标准,且为最常用的检测手段,但耗时太长,且在病原体鉴定、耐药性的检测和污染物确定等方面存在延误。研究发现使用血液培养的血流感染患病率为27%,mpcr检测脓毒症患者血流感染的敏感性和特异性分别为50% (n=7/14)和58% (n=18/31),血液培养的敏感性和特异性分别为36% (n=5/14)和68% (n=21/31)[1]。比较mpcr和血液培养阳性率时,mpcr更有可能检测到阳性血流感染。

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1血流感染的流行率[1]

(strep.sp.:喉炎症状的链球菌;mrsa:耐甲氧西林金黄色葡萄球菌;mssa :甲氧西林不敏感金黄色葡萄球菌;gnb-b:革兰氏阴性菌b;gnb-a:革兰氏阴性菌a;mpcr:多重pcr;bc:血液培养。)

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呼吸道感染


呼吸道感染包括上呼吸道感染和下呼吸道感染。通常由病毒、细菌、真菌、非典型病原体等引起,由于致病菌的不同以及感染部位的不同,患者症状也不一样,治疗时必须明确引起感染的病原体以选择对应的治疗方案。多重pcr检测可以对不同的病毒进行分型,例如甲流,副流感病毒等。可以有效缩短报告时间,并可以检测不同病原的共感染[2]

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图2:传统检测与mpcr检测比较[2]

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中枢神经系统感染


中枢神经系统感染性疾病具有进展迅速、致死致残率高等特征。导致中枢神经系统感染的常见病原体包括病毒、细菌、真菌等,临床症状不具有特异性。传统的病原体检测方法阳性率低、通量低、诊断周期长,60%-85%的患者无明确病原学诊断,患者被给予经验性治疗,不仅导致了抗生素的滥用及微生物的耐药,并且给患者带来了沉重的经济负担[3]。为有效降低该类疾病的不良影响,在临床上对导致疾病的病原体进行多重pcr检测是迫切需要的。

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图3:常规方法和mpcr试验鉴定病原体[3]

4

应用于耐药基因的检测


多重pcr检测可以同时检测病原体和耐药基因。如在检测金黄色葡萄球菌时,同时检测其耐药基因meca基因。clsi100对耐药基因的检测部分进行了非常详细的描述,也给予推荐,如meca基因,推荐考虑用分子靶标的技术来进行检测,比一些表型实验来的更加准确[4]


图4:基于多重pcr结果指导潜在抗生素治疗的桑基图[4]

(左:革兰氏菌株结果后的抗生素治疗,右:基于多重pcr结果后的潜在抗生素治疗。绿色用于抗生素降级,红色用于抗生素升级。灰色用于既不是升级也不是降级。)












荻硕贝肯超多重荧光pcr病原体筛查109种列表

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备注:
1、胞内分枝杆菌可同时检测胞内分枝杆菌与副胞内分枝杆菌。
2、沙雷氏菌属可同时检测粘质沙雷氏菌与液化沙雷氏菌。
3、产气/产酸克雷伯菌可同时检测产气克雷伯菌与产酸克雷伯菌。
4、布鲁菌属可同时检测牛布鲁菌,犬布鲁菌,猪布鲁菌,马耳他布鲁菌。
5、呼吸道合胞病毒可同时检测呼吸道合胞病毒a型与呼吸道合胞病毒b型。
6、鼻病毒可同时检测鼻病毒a型、鼻病毒b型、鼻病毒c型。
7、副流感病毒可同时检测人副流感病毒1型、人副流感病毒2型、人副流感病毒3型、人副流感病毒4型。
8、人类冠状病毒可同时检测人类冠状病毒229e、人类冠状病毒hku1、人类冠状病毒nl63、人类冠状病毒oc43。











总结

荻硕贝肯的109种超多重荧光 pcr检测产品包含病原体及耐药基因,可加强实验室对细菌、病毒、真菌、非典型病原以及耐药基因等的检测能力。多重核酸检测更全面,可以有效检出多种病原的共感染,有效提高多重核酸检测的效率,缩短病原体的报告时间,使用药更精准。













参考文献

[1].omar s,murphy s,gheevarghese r et al. a retrospective evaluation of a multiplex polymerase chain reaction test directly applied to blood for the management of sepsis in the critically ill.[j] .south afr j crit care, 2021, 37: undefined.

[2].chaonan fan,boliang fang·,hengmiao gao.applications of mpcr testing reduced initial antibiotic use and duration of mechanical ventilation in virusinfected children with severe communityacquired pneumonia admitted to the picu.world journal of pediatrics (2022) 18:449-452.

[3].kitano taito,nishikawa hiroki,suzuki rika et al. burden of pediatric central nervous system infection and cost-benefit simulation of multiplex polymerase chain reaction in japan.[j] .jpn j infect dis, 2021, 74: 144-147.

[4].mohammad nabila sher,nazli rubina,zafar hafsa et al. effects of lipid based multiple micronutrients supplement on the birth outcome of underweight pre-eclamptic women: a randomized clinical trial.[j] .pak j med sci, 2022, 38: 219-226.


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