疫情的不可控制,防不胜防,让新冠疫苗研发走上了巅峰时刻。其中不得不提的就是爆款ivd原料-----t7 rna polymerase。
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什么是t7 rna polymerase?
t7rna聚合酶(英语:t7 rna polymerase)是一种rna聚合酶,分子量约99kda。专门催化5'→3'方向的rna形成过程。该酶对t7启动子具有高度特异性,不识别其它生物来源的启动子。
t7 rna polymerase能以含有t7启动子序列的双链dna为模板,以ntps为底物,合成与启动子下游单链dna互补的rna,因此,t7 rna polymerase常应用于体外合成长转录本和短转录本。双链线性平末端或5’突出末端dna均可作为t7 rna polymerase的转录模板,因此线性质粒、pcr产物均可用作体外合成rna的模板。
此酶在合成rna的过程中,需要dna模板与镁离子(mg2 )作为辅因子。牛血清蛋白(bovine serum albumin,bsa)及精胺(spermidine)对此酶具促进效果。与细菌的rna聚合酶的差异之一,在于t7rna聚合酶不受抗生素立泛霉素(rifampicin)抑制。
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t7 rna polymerase用途
用于合成单链rna以作为杂交探针,基因组dna序列分析,核糖核酸酶保护测定,反义rna合成。
作为体外翻译的rna模板,rna剪接研究的底物,rna二级结构和rna-蛋白质相互作用,核酸扩增分析。
体外合成dsrna、sirna、mirna等rna。
可以识别修饰的核苷酸,例如生物素标记、荧光素标记、放射性同位素、地高辛标记dntp,用于各种标记rna的合成,进行下游实验。
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用于体外合成转录本
常见问题及米乐体育官方的解决方案
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转录产物产量低
模板的质量与产量密切相关,实验组产量明显低于对照组可能原因有:
①实验模板中有抑制反应成分;
②实验模板本身原因。
建议:
①重新纯化模板;
②确定模板定量以及其完整性;
③延长反应时间;
④加大模板投入量;
⑤尝试其它的启动子和rna聚合酶。
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短转录本产量低
转录起始片段短会抑制反应,转录产物小于100nt 时,延长反应时间至 4-8 小时或增加模板量至2ug可以提高rna产量。
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rna 转录长度大于预期
建议:
①检查模板是否完全线性化,如有必要,额外进行线性化;
②选择合适的限制性内切酶,避免产生有义链3’ 端突出,或者用 klenow fragment 或 t4 dna 聚合酶补齐后,再进行转录;
③使用变性胶检测rna 产物。
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rna 转录长度小于预期
如果电泳显示产物条带小于预期大小,可能原因:
①模板包含类似于t7 rna聚合酶的终止序列;
②模板中gc含量高。
建议:
①降低反应温度(比如,30℃),有时降低温度可以增加转录长度,但会降低产量。或者尝试不同的 rna 聚合酶进行转录;
②若模板gc含量高,采用 42℃进行转录反应,或者添加 ssb 提高产量及转录长度。
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转录产物电泳拖尾
电泳过程中有拖尾现象,可能原因:
①实验操作过程被rnase污染;
②dna模板被rnase污染。
建议:
①实验过程中使用rnase-free的枪头和ep管,佩戴一次性乳胶手套和口罩,所有试剂均用rnase-free h2o配制。
② 重新纯化模板 dna。
本文摘自---药精通 bio
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